Tất cả các loài đều bị ảnh hưởng trực tiếp bởi những thay đổi trong điều kiện môi trường đã thảo luận ở trên, cộng thêm ảnh hưởng gián tiếp thông qua sự tương tác của chúng với các loài khác. Mặc dù các tác động trực tiếp có thể dễ dự đoán và hình dung hơn, nhưng có khả năng các tác động gián tiếp cũng quan trọng không kém trong việc xác định phản ứng của thực vật đối với biến đổi khí hậu. [49] [50] Ví dụ, khi một loài thay đổi phân bố do hậu quả trực tiếp của biến đổi khí hậu, nó có thể xâm chiếm phạm vi của loài khác hoặc bị xâm chiếm, tạo ra mối quan hệ cạnh tranh mới hoặc thay đổi các quá trình khác như hấp thụ carbon . [51]

Một loại cỏ mới có thể lan đến một vùng làm thay đổi chế độ cháy và làm thay đổi lớn thành phần các loài. Một mầm bệnh hoặc ký sinh trùng có thể thay đổi tương tác của nó với cây trồng, chẳng hạn như một loại nấm gây bệnh trở nên phổ biến hơn khi một khu vực có nhiều mưa hơn. Nhiệt độ tăng có thể cho phép động vật ăn cỏ mở rộng hơn nữa vào các vùng núi cao, tác động đáng kể đến thành phần của các cánh đồng thảo mộc núi cao.